Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAP1GDS1P52306 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP1GDS1P52306 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP1GDS1P52306 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms