Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBP50607 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBP50607 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBP50607 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBP50607 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBP50607 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBP50607 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBP50607 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBP50607 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBP50607 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBP50607 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBP50607 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBP50607 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBP50607 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBP50607 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBP50607 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBP50607 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBP50607 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBP50607 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBP50607 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBP50607 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBP50607 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBP50607 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBP50607 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBP50607 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBP50607 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBP50607 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBP50607 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBP50607 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBP50607 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBP50607 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBP50607 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBP50607 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBP50607 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBP50607 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBP50607 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBP50607 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBP50607 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBP50607 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms