Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VEGFCP49767 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms