Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI2P48788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI2P48788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms