Protein–RNA interactions for Protein: P48594

SERPINB4, Serpin B4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB4P48594 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB4P48594 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINB4P48594 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms