Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL21P46778 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL21P46778 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL21P46778 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL21P46778 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL21P46778 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL21P46778 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL21P46778 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL21P46778 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL21P46778 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL21P46778 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL21P46778 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL21P46778 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL21P46778 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL21P46778 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL21P46778 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL21P46778 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL21P46778 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL21P46778 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL21P46778 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL21P46778 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL21P46778 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL21P46778 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL21P46778 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL21P46778 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL21P46778 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL21P46778 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL21P46778 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL21P46778 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL21P46778 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL21P46778 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL21P46778 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPL21P46778 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL21P46778 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL21P46778 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL21P46778 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL21P46778 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL21P46778 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL21P46778 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL21P46778 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL21P46778 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL21P46778 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL21P46778 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms