Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF5P43026 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF5P43026 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF5P43026 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF5P43026 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF5P43026 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF5P43026 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF5P43026 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF5P43026 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF5P43026 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF5P43026 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF5P43026 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF5P43026 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF5P43026 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF5P43026 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF5P43026 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF5P43026 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF5P43026 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF5P43026 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF5P43026 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF5P43026 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF5P43026 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF5P43026 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF5P43026 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF5P43026 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF5P43026 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF5P43026 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF5P43026 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF5P43026 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF5P43026 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF5P43026 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF5P43026 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF5P43026 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF5P43026 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF5P43026 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF5P43026 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF5P43026 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF5P43026 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF5P43026 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF5P43026 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF5P43026 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF5P43026 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF5P43026 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF5P43026 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF5P43026 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF5P43026 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF5P43026 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF5P43026 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF5P43026 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF5P43026 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF5P43026 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF5P43026 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF5P43026 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF5P43026 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF5P43026 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF5P43026 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF5P43026 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF5P43026 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF5P43026 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF5P43026 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF5P43026 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF5P43026 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF5P43026 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms