Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FEN1P39748 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FEN1P39748 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FEN1P39748 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FEN1P39748 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FEN1P39748 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FEN1P39748 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FEN1P39748 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FEN1P39748 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FEN1P39748 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FEN1P39748 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FEN1P39748 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FEN1P39748 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FEN1P39748 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FEN1P39748 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FEN1P39748 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FEN1P39748 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FEN1P39748 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FEN1P39748 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FEN1P39748 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FEN1P39748 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FEN1P39748 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FEN1P39748 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FEN1P39748 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FEN1P39748 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FEN1P39748 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FEN1P39748 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FEN1P39748 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FEN1P39748 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FEN1P39748 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FEN1P39748 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FEN1P39748 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FEN1P39748 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FEN1P39748 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FEN1P39748 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FEN1P39748 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FEN1P39748 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FEN1P39748 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FEN1P39748 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FEN1P39748 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FEN1P39748 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FEN1P39748 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FEN1P39748 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FEN1P39748 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FEN1P39748 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FEN1P39748 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FEN1P39748 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms