Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FDFT1P37268 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDFT1P37268 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms