Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E1P36543 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms