Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHI3L1P36222 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms