Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC1P35251 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC1P35251 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC1P35251 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC1P35251 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFC1P35251 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC1P35251 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC1P35251 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC1P35251 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC1P35251 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC1P35251 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC1P35251 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFC1P35251 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC1P35251 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC1P35251 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC1P35251 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC1P35251 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFC1P35251 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFC1P35251 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC1P35251 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFC1P35251 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFC1P35251 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFC1P35251 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC1P35251 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC1P35251 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC1P35251 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC1P35251 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC1P35251 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC1P35251 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC1P35251 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC1P35251 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC1P35251 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC1P35251 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC1P35251 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC1P35251 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC1P35251 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC1P35251 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC1P35251 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC1P35251 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC1P35251 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC1P35251 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC1P35251 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC1P35251 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC1P35251 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC1P35251 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms