Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA5P31644 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GABRA5P31644 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms