Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD40LGP29965 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CD40LGP29965 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms