Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP1P29466 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP1P29466 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP1P29466 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP1P29466 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP1P29466 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP1P29466 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP1P29466 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP1P29466 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP1P29466 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP1P29466 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP1P29466 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP1P29466 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP1P29466 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP1P29466 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP1P29466 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP1P29466 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP1P29466 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP1P29466 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP1P29466 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP1P29466 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP1P29466 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP1P29466 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP1P29466 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP1P29466 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP1P29466 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP1P29466 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP1P29466 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP1P29466 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP1P29466 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP1P29466 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP1P29466 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP1P29466 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP1P29466 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP1P29466 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP1P29466 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP1P29466 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP1P29466 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP1P29466 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP1P29466 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP1P29466 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP1P29466 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP1P29466 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP1P29466 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP1P29466 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP1P29466 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP1P29466 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP1P29466 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP1P29466 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP1P29466 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP1P29466 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP1P29466 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP1P29466 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP1P29466 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP1P29466 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP1P29466 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP1P29466 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP1P29466 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP1P29466 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP1P29466 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP1P29466 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP1P29466 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP1P29466 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP1P29466 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP1P29466 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP1P29466 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP1P29466 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP1P29466 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP1P29466 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP1P29466 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP1P29466 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP1P29466 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASP1P29466 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASP1P29466 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP1P29466 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP1P29466 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP1P29466 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP1P29466 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP1P29466 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP1P29466 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP1P29466 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP1P29466 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms