Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMLP26374 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMLP26374 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMLP26374 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMLP26374 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMLP26374 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMLP26374 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMLP26374 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMLP26374 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMLP26374 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMLP26374 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMLP26374 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMLP26374 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMLP26374 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMLP26374 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMLP26374 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMLP26374 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMLP26374 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMLP26374 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMLP26374 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMLP26374 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMLP26374 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHMLP26374 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHMLP26374 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMLP26374 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMLP26374 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMLP26374 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMLP26374 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHMLP26374 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMLP26374 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMLP26374 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMLP26374 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMLP26374 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHMLP26374 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMLP26374 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMLP26374 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHMLP26374 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMLP26374 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMLP26374 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMLP26374 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHMLP26374 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMLP26374 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMLP26374 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMLP26374 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMLP26374 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHMLP26374 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHMLP26374 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHMLP26374 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHMLP26374 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMLP26374 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHMLP26374 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHMLP26374 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMLP26374 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMLP26374 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMLP26374 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMLP26374 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMLP26374 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHMLP26374 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMLP26374 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMLP26374 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms