Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMA3P25788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA3P25788 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA3P25788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms