Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
YY1P25490 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
YY1P25490 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
YY1P25490 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YY1P25490 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
YY1P25490 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
YY1P25490 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YY1P25490 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YY1P25490 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YY1P25490 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
YY1P25490 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
YY1P25490 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
YY1P25490 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YY1P25490 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YY1P25490 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YY1P25490 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YY1P25490 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YY1P25490 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YY1P25490 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
YY1P25490 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YY1P25490 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YY1P25490 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YY1P25490 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YY1P25490 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YY1P25490 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
YY1P25490 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YY1P25490 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YY1P25490 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YY1P25490 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YY1P25490 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YY1P25490 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
YY1P25490 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
YY1P25490 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
YY1P25490 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YY1P25490 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
YY1P25490 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
YY1P25490 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
YY1P25490 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YY1P25490 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YY1P25490 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YY1P25490 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YY1P25490 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
YY1P25490 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YY1P25490 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YY1P25490 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YY1P25490 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
YY1P25490 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
YY1P25490 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
YY1P25490 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
YY1P25490 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
YY1P25490 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
YY1P25490 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
YY1P25490 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
YY1P25490 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
YY1P25490 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
YY1P25490 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
YY1P25490 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
YY1P25490 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
YY1P25490 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
YY1P25490 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
YY1P25490 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
YY1P25490 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
YY1P25490 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
YY1P25490 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
YY1P25490 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
YY1P25490 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
YY1P25490 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
YY1P25490 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
YY1P25490 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
YY1P25490 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
YY1P25490 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
YY1P25490 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
YY1P25490 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
YY1P25490 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
YY1P25490 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
YY1P25490 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
YY1P25490 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
YY1P25490 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
YY1P25490 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
YY1P25490 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
YY1P25490 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
YY1P25490 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
YY1P25490 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
YY1P25490 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
YY1P25490 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
YY1P25490 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
YY1P25490 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
YY1P25490 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
YY1P25490 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
YY1P25490 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
YY1P25490 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
YY1P25490 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
YY1P25490 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
YY1P25490 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
YY1P25490 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
YY1P25490 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
YY1P25490 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YY1P25490 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YY1P25490 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
YY1P25490 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms