Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR1P25024 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR1P25024 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR1P25024 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms