Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDELR1P24390 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR1P24390 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms