Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA5P20719 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA5P20719 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms