Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTPS1P17812 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTPS1P17812 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms