Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DESP17661 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DESP17661 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DESP17661 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DESP17661 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DESP17661 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DESP17661 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DESP17661 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DESP17661 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DESP17661 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DESP17661 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DESP17661 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DESP17661 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DESP17661 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DESP17661 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DESP17661 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DESP17661 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DESP17661 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DESP17661 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DESP17661 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DESP17661 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DESP17661 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DESP17661 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DESP17661 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DESP17661 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DESP17661 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DESP17661 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DESP17661 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DESP17661 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DESP17661 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DESP17661 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DESP17661 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DESP17661 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DESP17661 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DESP17661 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DESP17661 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DESP17661 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DESP17661 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DESP17661 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DESP17661 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DESP17661 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DESP17661 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DESP17661 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DESP17661 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DESP17661 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DESP17661 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DESP17661 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DESP17661 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DESP17661 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DESP17661 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DESP17661 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DESP17661 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DESP17661 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DESP17661 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DESP17661 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DESP17661 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DESP17661 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DESP17661 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DESP17661 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DESP17661 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DESP17661 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DESP17661 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DESP17661 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DESP17661 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DESP17661 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DESP17661 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DESP17661 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DESP17661 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DESP17661 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DESP17661 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DESP17661 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DESP17661 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DESP17661 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DESP17661 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DESP17661 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DESP17661 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DESP17661 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DESP17661 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DESP17661 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DESP17661 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DESP17661 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DESP17661 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms