Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB1P14653 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB1P14653 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms