Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HLA-DOBP13765 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DOBP13765 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms