Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 RAD3YER171W 2337 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 RPL7AYGL076C 735 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 PHB1YGR132C 864 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 RPE1YJL121C 717 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 RPL7BYPL198W 735 nt5.05□□□□□ -1.6
MSI1P13712 GPA2YER020W 1350 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 HAS1YMR290C 1518 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 LSG1YGL099W 1923 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 EGD2YHR193C 525 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 ECM19YLR390W 339 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 CIN4YMR138W 576 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 CLB2YPR119W 1476 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 EMW1YNL313C 2715 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 DUG1YFR044C 1446 nt5.04□□□□□ -1.6
MSI1P13712 MCM3YEL032W 2916 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 IES1YFL013C 2079 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 ERP5YHR110W 639 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 RPN7YPR108W 1290 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 YBR124WYBR124W 360 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 MRPS5YBR251W 924 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 PCS60YBR222C 1632 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 PAP2YOL115W 1755 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 ASN1YPR145W 1719 nt5.03□□□□□ -1.6
MSI1P13712 TRP5YGL026C 2124 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 HAP2YGL237C 798 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 COS6YGR295C 1146 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 ASK1YKL052C 879 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YLR126CYLR126C 756 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 SHP1YBL058W 1272 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 UBC11YOR339C 471 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 LDB19YOR322C 2457 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 MNS1YJR131W 1650 nt5.02□□□□□ -1.61
MSI1P13712 MRC1YCL061C 3291 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 PAT1YCR077C 2391 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 SUB2YDL084W 1341 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 GPB2YAL056W 2643 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YFL042CYFL042C 2025 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YDL172CYDL172C 480 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 RME1YGR044C 903 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 HSP150YJL159W 1242 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YJU3YKL094W 942 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 CBT1YKL208W 816 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 DPB2YPR175W 2070 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 CHL4YDR254W 1377 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 IME2YJL106W 1938 nt5.01□□□□□ -1.61
MSI1P13712 RSC2YLR357W 2670 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YDR109CYDR109C 2148 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 GIT1YCR098C 1557 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 PYC1YGL062W 3537 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 BZZ1YHR114W 1902 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 PRS2YER099C 957 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YML012C-AYML012C-A 378 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 TFB4YPR056W 1017 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 APM4YOL062C 1476 nt5□□□□□ -1.61
MSI1P13712 XBP1YIL101C 1944 nt4.99□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YPK2YMR104C 2034 nt4.99□□□□□ -1.61
MSI1P13712 UGX2YDL169C 672 nt4.99□□□□□ -1.61
MSI1P13712 SYF2YGR129W 648 nt4.99□□□□□ -1.61
MSI1P13712 CWC27YPL064C 906 nt4.99□□□□□ -1.61
MSI1P13712 COR1YBL045C 1374 nt4.99□□□□□ -1.61
MSI1P13712 MTC5YDR128W 3447 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 HIR1YBL008W 2523 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 APE3YBR286W 1614 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YDL023CYDL023C 321 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YDL144CYDL144C 1071 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 SOH1YGL127C 384 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YHR140WYHR140W 720 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 RHO4YKR055W 876 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 GEP5YLR091W 882 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 VMA4YOR332W 702 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YBR144CYBR144C 315 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 ATG12YBR217W 561 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 MSS116YDR194C 1995 nt4.98□□□□□ -1.61
MSI1P13712 MTF2YDL044C 1323 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 GAT1YFL021W 1533 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 CNM67YNL225C 1746 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 TRP1YDR007W 675 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 DFM1YDR411C 1026 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 RPS2YGL123W 765 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 DJP1YIR004W 1299 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 TAL1YLR354C 1008 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 MRP51YPL118W 1035 nt4.97□□□□□ -1.61
MSI1P13712 ISN1YOR155C 1353 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 CDC10YCR002C 969 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 LYS12YIL094C 1116 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 RPL10YLR075W 666 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 RPS9AYPL081W 594 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 REG2YBR050C 1017 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 NHP6BYBR089C-A 300 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 ERC1YHR032W 1746 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 PAP1YKR002W 1707 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 DIA3YDL024C 1407 nt4.96□□□□□ -1.62
MSI1P13712 HSP78YDR258C 2436 nt4.95□□□□□ -1.62
MSI1P13712 KEX2YNL238W 2445 nt4.95□□□□□ -1.62
MSI1P13712 VTH1YIL173W 4650 nt4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.6 ms