Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VCANP13611 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCANP13611 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCANP13611 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCANP13611 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCANP13611 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VCANP13611 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VCANP13611 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VCANP13611 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCANP13611 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCANP13611 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCANP13611 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCANP13611 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCANP13611 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCANP13611 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCANP13611 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCANP13611 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCANP13611 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCANP13611 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCANP13611 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCANP13611 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCANP13611 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VCANP13611 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCANP13611 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCANP13611 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCANP13611 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCANP13611 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VCANP13611 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCANP13611 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCANP13611 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCANP13611 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCANP13611 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCANP13611 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCANP13611 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCANP13611 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCANP13611 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCANP13611 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCANP13611 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCANP13611 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCANP13611 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCANP13611 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCANP13611 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCANP13611 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCANP13611 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VCANP13611 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VCANP13611 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCANP13611 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCANP13611 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCANP13611 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCANP13611 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCANP13611 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCANP13611 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCANP13611 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCANP13611 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCANP13611 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCANP13611 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCANP13611 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCANP13611 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VCANP13611 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCANP13611 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCANP13611 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCANP13611 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCANP13611 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCANP13611 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCANP13611 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCANP13611 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCANP13611 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCANP13611 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCANP13611 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCANP13611 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCANP13611 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCANP13611 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms