Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX6A1P12074 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms