Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFD1P11586 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFD1P11586 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms