Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBL4AP11441 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBL4AP11441 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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