Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
C4BP0C0L5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
C4BP0C0L5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
C4BP0C0L5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
C4BP0C0L5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
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