Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD48P09326 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD48P09326 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD48P09326 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD48P09326 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD48P09326 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD48P09326 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD48P09326 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD48P09326 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD48P09326 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD48P09326 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD48P09326 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD48P09326 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD48P09326 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD48P09326 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD48P09326 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD48P09326 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CD48P09326 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD48P09326 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD48P09326 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD48P09326 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD48P09326 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD48P09326 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD48P09326 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD48P09326 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD48P09326 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD48P09326 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD48P09326 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD48P09326 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD48P09326 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD48P09326 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD48P09326 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD48P09326 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD48P09326 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD48P09326 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD48P09326 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD48P09326 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD48P09326 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD48P09326 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD48P09326 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD48P09326 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD48P09326 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD48P09326 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD48P09326 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD48P09326 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CD48P09326 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD48P09326 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD48P09326 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD48P09326 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD48P09326 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD48P09326 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD48P09326 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD48P09326 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CD48P09326 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD48P09326 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD48P09326 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD48P09326 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD48P09326 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CD48P09326 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD48P09326 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD48P09326 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD48P09326 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD48P09326 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD48P09326 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD48P09326 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD48P09326 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD48P09326 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD48P09326 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD48P09326 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms