Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPSAP08865 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPSAP08865 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPSAP08865 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPSAP08865 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPSAP08865 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPSAP08865 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPSAP08865 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPSAP08865 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPSAP08865 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPSAP08865 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPSAP08865 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPSAP08865 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPSAP08865 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPSAP08865 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPSAP08865 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPSAP08865 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPSAP08865 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPSAP08865 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPSAP08865 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms