Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRCP08575 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRCP08575 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRCP08575 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
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