Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPIND1P05546 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPIND1P05546 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms