Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT1P04264 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT1P04264 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT1P04264 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT1P04264 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT1P04264 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT1P04264 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT1P04264 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT1P04264 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT1P04264 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT1P04264 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT1P04264 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT1P04264 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT1P04264 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT1P04264 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT1P04264 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT1P04264 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT1P04264 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT1P04264 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT1P04264 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT1P04264 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT1P04264 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT1P04264 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT1P04264 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT1P04264 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT1P04264 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT1P04264 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT1P04264 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT1P04264 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT1P04264 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT1P04264 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT1P04264 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT1P04264 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT1P04264 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT1P04264 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT1P04264 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT1P04264 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT1P04264 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT1P04264 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT1P04264 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT1P04264 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT1P04264 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT1P04264 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT1P04264 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT1P04264 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT1P04264 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT1P04264 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT1P04264 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT1P04264 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT1P04264 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT1P04264 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT1P04264 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT1P04264 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT1P04264 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT1P04264 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT1P04264 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT1P04264 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT1P04264 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT1P04264 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms