Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPSP04118 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPSP04118 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPSP04118 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPSP04118 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPSP04118 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPSP04118 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPSP04118 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPSP04118 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPSP04118 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPSP04118 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSP04118 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPSP04118 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPSP04118 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPSP04118 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPSP04118 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPSP04118 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSP04118 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSP04118 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSP04118 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSP04118 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSP04118 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSP04118 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSP04118 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSP04118 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSP04118 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPSP04118 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPSP04118 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPSP04118 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPSP04118 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPSP04118 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPSP04118 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPSP04118 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPSP04118 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSP04118 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSP04118 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSP04118 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSP04118 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSP04118 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSP04118 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSP04118 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSP04118 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSP04118 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSP04118 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSP04118 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSP04118 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSP04118 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSP04118 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms