Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC2P02655 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC2P02655 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOC2P02655 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOC2P02655 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC2P02655 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC2P02655 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC2P02655 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC2P02655 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC2P02655 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC2P02655 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC2P02655 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC2P02655 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC2P02655 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOC2P02655 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC2P02655 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC2P02655 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC2P02655 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC2P02655 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC2P02655 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC2P02655 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC2P02655 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC2P02655 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC2P02655 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC2P02655 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC2P02655 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC2P02655 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC2P02655 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC2P02655 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC2P02655 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC2P02655 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC2P02655 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC2P02655 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC2P02655 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC2P02655 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC2P02655 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC2P02655 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC2P02655 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC2P02655 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC2P02655 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC2P02655 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC2P02655 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC2P02655 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC2P02655 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC2P02655 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC2P02655 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC2P02655 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC2P02655 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC2P02655 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC2P02655 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC2P02655 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC2P02655 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC2P02655 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC2P02655 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC2P02655 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC2P02655 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC2P02655 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC2P02655 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC2P02655 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC2P02655 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms