Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFP01375 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFP01375 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFP01375 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFP01375 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFP01375 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFP01375 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFP01375 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFP01375 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFP01375 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFP01375 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFP01375 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFP01375 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFP01375 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFP01375 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFP01375 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFP01375 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFP01375 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFP01375 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFP01375 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFP01375 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFP01375 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFP01375 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFP01375 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFP01375 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFP01375 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFP01375 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFP01375 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFP01375 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFP01375 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFP01375 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFP01375 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFP01375 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFP01375 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFP01375 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNFP01375 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFP01375 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFP01375 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFP01375 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFP01375 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFP01375 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFP01375 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFP01375 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFP01375 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFP01375 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFP01375 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFP01375 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFP01375 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFP01375 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFP01375 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFP01375 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms