Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASS1P00966 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASS1P00966 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASS1P00966 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASS1P00966 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASS1P00966 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASS1P00966 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASS1P00966 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASS1P00966 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASS1P00966 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASS1P00966 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASS1P00966 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASS1P00966 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASS1P00966 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASS1P00966 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASS1P00966 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASS1P00966 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASS1P00966 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASS1P00966 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASS1P00966 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASS1P00966 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASS1P00966 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASS1P00966 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASS1P00966 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASS1P00966 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ASS1P00966 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASS1P00966 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ASS1P00966 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASS1P00966 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASS1P00966 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASS1P00966 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASS1P00966 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASS1P00966 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ASS1P00966 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASS1P00966 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASS1P00966 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASS1P00966 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASS1P00966 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASS1P00966 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASS1P00966 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASS1P00966 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ASS1P00966 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ASS1P00966 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASS1P00966 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ASS1P00966 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ASS1P00966 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASS1P00966 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASS1P00966 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASS1P00966 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASS1P00966 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASS1P00966 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASS1P00966 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ASS1P00966 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASS1P00966 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASS1P00966 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASS1P00966 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASS1P00966 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASS1P00966 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASS1P00966 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASS1P00966 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASS1P00966 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASS1P00966 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASS1P00966 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms