Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPP00450 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPP00450 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPP00450 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPP00450 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPP00450 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPP00450 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPP00450 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPP00450 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPP00450 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPP00450 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPP00450 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPP00450 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPP00450 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPP00450 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPP00450 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPP00450 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPP00450 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPP00450 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPP00450 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPP00450 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPP00450 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPP00450 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPP00450 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPP00450 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPP00450 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPP00450 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPP00450 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPP00450 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPP00450 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPP00450 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPP00450 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPP00450 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPP00450 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPP00450 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPP00450 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPP00450 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPP00450 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPP00450 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPP00450 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPP00450 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPP00450 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPP00450 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPP00450 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPP00450 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPP00450 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPP00450 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPP00450 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPP00450 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPP00450 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPP00450 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPP00450 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPP00450 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPP00450 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPP00450 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPP00450 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPP00450 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms