Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX7O95931 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX7O95931 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX7O95931 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX7O95931 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX7O95931 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX7O95931 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX7O95931 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX7O95931 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX7O95931 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX7O95931 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX7O95931 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX7O95931 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX7O95931 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX7O95931 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX7O95931 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX7O95931 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX7O95931 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX7O95931 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX7O95931 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX7O95931 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX7O95931 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX7O95931 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX7O95931 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX7O95931 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX7O95931 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX7O95931 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX7O95931 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX7O95931 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX7O95931 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX7O95931 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX7O95931 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX7O95931 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX7O95931 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX7O95931 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX7O95931 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX7O95931 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX7O95931 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX7O95931 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX7O95931 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX7O95931 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX7O95931 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX7O95931 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX7O95931 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX7O95931 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX7O95931 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX7O95931 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX7O95931 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX7O95931 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX7O95931 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms