Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYF2O95926 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYF2O95926 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYF2O95926 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYF2O95926 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYF2O95926 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYF2O95926 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYF2O95926 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYF2O95926 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYF2O95926 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYF2O95926 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYF2O95926 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYF2O95926 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYF2O95926 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYF2O95926 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYF2O95926 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYF2O95926 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYF2O95926 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYF2O95926 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYF2O95926 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYF2O95926 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYF2O95926 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYF2O95926 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYF2O95926 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYF2O95926 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYF2O95926 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYF2O95926 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYF2O95926 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYF2O95926 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYF2O95926 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYF2O95926 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYF2O95926 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYF2O95926 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYF2O95926 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYF2O95926 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYF2O95926 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYF2O95926 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYF2O95926 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms