Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB36O95755 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB36O95755 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB36O95755 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB36O95755 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB36O95755 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB36O95755 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB36O95755 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB36O95755 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB36O95755 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB36O95755 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB36O95755 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB36O95755 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB36O95755 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB36O95755 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB36O95755 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB36O95755 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB36O95755 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB36O95755 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB36O95755 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB36O95755 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB36O95755 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB36O95755 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB36O95755 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB36O95755 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB36O95755 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB36O95755 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB36O95755 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB36O95755 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB36O95755 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms