Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN9O95484 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN9O95484 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN9O95484 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN9O95484 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms