Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GABARAPO95166 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPO95166 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPO95166 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 550.2 ms