Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG2O94898 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIG2O94898 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms