Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC43A1O75387 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC43A1O75387 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC43A1O75387 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC43A1O75387 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC43A1O75387 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC43A1O75387 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC43A1O75387 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC43A1O75387 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC43A1O75387 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC43A1O75387 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC43A1O75387 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC43A1O75387 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC43A1O75387 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms