Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF253O75346 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF253O75346 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF253O75346 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms