Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NBNO60934 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBNO60934 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBNO60934 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBNO60934 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBNO60934 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBNO60934 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBNO60934 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBNO60934 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBNO60934 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBNO60934 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBNO60934 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBNO60934 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBNO60934 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBNO60934 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBNO60934 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NBNO60934 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBNO60934 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBNO60934 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBNO60934 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBNO60934 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBNO60934 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBNO60934 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBNO60934 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBNO60934 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBNO60934 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBNO60934 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NBNO60934 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBNO60934 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBNO60934 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBNO60934 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBNO60934 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBNO60934 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBNO60934 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NBNO60934 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBNO60934 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBNO60934 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBNO60934 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NBNO60934 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBNO60934 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBNO60934 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBNO60934 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBNO60934 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBNO60934 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBNO60934 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBNO60934 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBNO60934 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBNO60934 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NBNO60934 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBNO60934 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBNO60934 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBNO60934 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBNO60934 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBNO60934 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBNO60934 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBNO60934 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBNO60934 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBNO60934 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBNO60934 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBNO60934 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBNO60934 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBNO60934 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBNO60934 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBNO60934 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBNO60934 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBNO60934 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBNO60934 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBNO60934 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBNO60934 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms